和液氮超低温冻存这两种保藏方法进行比较，这两种方法均是通过把孢子或菌丝体与冷冻保护剂混匀后进行保藏，只是保藏的环境不同。 其对比如下：
1、效价比较
用恩拉霉素的冻存孢子分别进行两种方法的保藏，过一定时间后进行效价的验证，在保存时间上对这两种方法进行比较。 可以看出用菌种低温冰箱保藏2年后效价降低2.2%，而液氮超低温保藏法2年后效价降低1.4%，因为每个时间点验证的是同一个菌种相同的菌种号，两种保藏方法相差0.8%，通过数据分析可知还是液氮超低温保藏法保藏年限比较长，不容易发爱博体育产能力退化。而菌种低温冰箱略有退化，菌种低温冰箱比较适合于保藏周期中短期的菌种，生产菌种保藏周期较短适合于超低温冷冻保藏法。
2、费用比较
两种保藏方法从保藏费用上进行比较，菌种低温冰箱用的是100W的超低温保存箱保藏，每月的耗电量在800度电左右，而且菌种低温冰箱的空间较大，可同时保藏1000支冻存菌丝或冻存孢子，电费按0.5元/度，每支管1个月保藏费用为约0.4元。液氮超低温保藏法，需要使用专用的液氮罐，1个50L的液氮罐保藏菌种量为200支左右，每月正常需要补充30L左右的液氮，液氮按10元/L，每支1个月管的保藏费用约为1.5元。
3、安全系数
两种方法从安全系数上进行比较，液氮的保藏温度为-196℃，对冻存管的质量要求较高，必须严格采用耐低温的材质，而且冻存管放入液氮罐后前后温差变化较大，管口容易变松掉帽造成染菌。或使液氮进入管内导致拿取时管内液氮温度变高，液氮气化发生炸管，对工作人员造成伤害。而菌种低温冰箱相对于液氮保藏法，瞬间温差不是很大，不会造成管口变松、炸管。
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